一、非传染性犊牛腹泻
犊牛免疫力低下：犊牛出生后没有能够及时吃到初乳或乳量不足，使体内形成抗体的免疫球蛋白贫乏，导致犊牛免疫力低下，对疾病及环境变化的抵抗能力降低，如果胎便不能及时排除的话，就会由于胎便的发酵，产生一些有*有害物质，刺激胃肠黏膜从而引起腹泻的发生。出生1～2个月的犊牛由于此种原因导致的腹泻往往发病率和死亡率都很高。
母牛的身体状况及营养水平不良：妊娠母牛的身体状况不佳，比较瘦弱，则容易产出体弱的犊牛，这样的犊牛往往抵抗力低下、体质衰弱，容易发生腹泻。另外，哺乳期母牛营养状况不良的话，所产乳汁也往往营养不好，如母乳中维生素B缺乏，会导致犊牛胃肠蠕动机能障碍，维生素C缺乏会使幼畜胃的分泌机能减弱，这些都会导致犊牛腹泻发生率的升高。
犊牛饲喂不当：犊牛出生后取食初乳过晚的话，有可能因为饥饿而舔舐周围污物，由于肠道功能较弱，有害菌大量繁殖后出现腹泻的症状，所以，让犊牛及时开口取食牛初乳极其重要。另外，如果进行人工哺乳，一定要定时、定量且乳汁的温度要适宜，温度过高或过低都极易导致腹泻的发生。乳汁温度过低，可引起犊牛胃肠机能失常，引起腹泻，温度过高会引起口腔炎、胃肠炎，抑制胃肠分泌和蠕动机能，导致腹泻的发生。
犊牛在断奶阶段也容易出现腹泻，主要是由于食物突然从液体转变为固体，体内的消化酶需要一定的时间去适应这种变化，这时犊牛消化不良引起的腹泻极易发生。另外，犊牛的饮水不当也会引起腹泻的发生。当犊牛口渴时，如果未能及时饮水，则容易导致在饮水时突然饮用量过大，从而导致水中*的出现，造成发病。
环境应激：牛舍内通风不良、过于拥挤、秋冬季节气候骤变等因素都会导致犊牛出现应激反应而出现腹泻。
药物因素：犊牛如果发生了其他疾病，在治疗过程中使用药物不当，也会引起腹泻发生。比如，犊牛发生了便秘，在治疗便秘时若使用泻剂过量，可引起犊牛腹泻。犊牛长期应用抗生素，会导致体内微生物菌群失调，消化功能下降而导致腹泻的产生。
二、传染性犊牛腹泻
细菌性腹泻：犊牛白痢、犊牛副伤寒是最常见的引起犊牛腹泻的两种细菌性疾病。犊牛白痢是由大肠杆菌引起的一种急性传染病，临床上依据症状可分为败血型、肠*血型、肠炎型3种，以败血型最为常见，主要症状为败血症及腹泻，粪便淡灰白色。该病主要危害新生犊牛，特别是出生后1～3日龄的犊牛最易发病，死亡率高达80%以上。犊牛副伤寒是由沙门氏菌引起的一种传染病。临床症状主要表现为高烧不退、腹式呼吸、腹痛剧烈、腹泻严重，粪便为灰*色黏液，具有恶臭味道，有时混有血丝，发病严重未得到及时治疗的患牛常于3～5天死亡，死亡率最高可达50%。该病主要经消化道传染，一年四季均可发病。
病*性腹泻：病*性腹泻是引起犊牛腹泻的一个最重要的因素，常见的病*主要包括轮状病*、冠状病*等，轮状病*感染引起的腹泻，1周龄以内的犊牛最容易发病，冠状病*感染引起的腹泻，2～3周龄犊牛最易发病。病*引起的腹泻，粪便多呈*白色水状，同时犊牛出现全身症状如精神萎靡、厌食、呕吐等。病*主要通过消化道和呼吸道传播，已发病的动物是主要传染源，冬春季发病率较高。
寄生虫性腹泻：犊牛发生寄生虫感染后也容易出现腹泻的症状，比较常见的寄生虫主要有球虫、蛔虫、隐孢子虫等。新出生的犊牛由于抵抗力差，相对比较容易感染寄生虫。犊牛感染蛔虫后，会引起犊牛肠炎、下痢、腹痛等，粪便具有恶臭的味道，有时会排除蛔虫虫体，14～日龄的犊牛症状最为严重。犊牛感染球虫病后以恶臭的血痢、消瘦为主要症状。发病初期，粪便中常混有血丝，随着病情发展严重后粪便中会混有大量的血水及肠黏膜，病牛常卧地不起。